rna修饰作为表观遗传机制之一,是维持生物体稳态的重要且保守的机制。目前对细粒棘球绦虫的 rna 修饰知之甚少,棘球绦虫是一种寄生于哺乳动物的专性寄生虫,对公共健康和经济产生巨大影响。在这里,我们首次使用质谱 (uplc-ms/ms) 对细粒棘球绦虫的中绦期幼虫-细粒棘球蚴总rna中的47种rna修饰进行了定性和定量分析,重点研究了细粒棘球蚴的rna修饰特征。此外,鉴定了进行rna修饰的写入酶的细粒棘球蚴绦虫同源物,并通过生物信息学分析分析了它们在不同发育阶段的基因表达模式。最后,在细粒棘球蚴包囊的总rna中发现了23种类型的rna修饰。同时,在细粒棘球蚴绦虫基因组中鉴定了参与这些修饰的写入酶的同源物,在不同的寄生虫发育阶段具有动态基因表达。这项工作证实了细粒棘球蚴在进化过程中保留了保守的rna修饰机制,表明rna 修饰可能在调节细粒棘球蚴发育和寄生过程中具有重要的作用。此外,寄生虫和宿主之间rna修饰写入酶氨基酸序列的差异使得这些酶作为后续深入研究的候选药物靶点成为可能。
本文第一作者是中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所刘丛珊副研究员。该文发表在infection, genetics and evolution, 2021, 96, 105124. https://doi.org/10.1016/j.meegid.2021.105124。
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